Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRISP3P54108 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRISP3P54108 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms