Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	RCE1	YMR274C	948 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	PEX15	YOL044W	1152 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	MCA1	YOR197W	1299 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	FIG1	YBR040W	897 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	PRM4	YPL156C	855 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	YPL276W	YPL276W	438 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	YPL150W	YPL150W	2706 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	YHR078W	YHR078W	1659 nt		2.78	□□□□□ -1.96
KTR6	P54070	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SLP1	YOR154W	1764 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RIM1	YCR028C-A	408 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	snR83	snR83	306 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	LIP2	YLR239C	987 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	URA5	YML106W	681 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YBL028C	YBL028C	321 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SUB1	YMR039C	879 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	INP1	YMR204C	1263 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YNR062C	YNR062C	984 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.77	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	HBT1	YDL223C	3141 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SRC1	YML034W	2505 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	ARF1	YDL192W	546 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	STE2	YFL026W	1296 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YHR097C	YHR097C	1101 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	GRX7	YBR014C	612 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YBR287W	YBR287W	1284 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	AYT1	YLL063C	1425 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.76	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	BNI4	YNL233W	2679 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	WHI3	YNL197C	1986 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RGI1	YER067W	486 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	tW(CCA)G1	tW(CCA)G1	72 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	tW(CCA)G2	tW(CCA)G2	72 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	tW(CCA)J	tW(CCA)J	72 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	tW(CCA)K	tW(CCA)K	72 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	tW(CCA)M	tW(CCA)M	72 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	tW(CCA)P	tW(CCA)P	72 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	DAD2	YKR083C	402 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SME1	YOR159C	285 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	CUP9	YPL177C	921 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	TAF2	YCR042C	4224 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SIN3	YOL004W	4611 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YCL019W	YCL019W	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	MPS1	YDL028C	2295 nt		2.75	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.74	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	CTK2	YJL006C	972 nt		2.74	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	snR24	snR24	89 nt		2.74	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.74	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		2.74	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	PSP1	YDR505C	2526 nt		2.74	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	APM3	YBR288C	1452 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RPL13A	YDL082W	600 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	UBC5	YDR059C	447 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	DPP1	YDR284C	870 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	MRPL9	YGR220C	810 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YHL044W	YHL044W	708 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YAR069C	YAR069C	294 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YLR400W	YLR400W	474 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	PEX27	YOR193W	1131 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RFC5	YBR087W	1065 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YBR090C	YBR090C	369 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	IRC3	YDR332W	2070 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	BNA4	YBL098W	1383 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	AXL1	YPR122W	3627 nt		2.73	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	GCD2	YGR083C	1956 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	INP52	YNL106C	3552 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	TCD1	YHR003C	1290 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	RNR2	YJL026W	1200 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YPT52	YKR014C	705 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	TDA8	YAL064C-A	381 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	ERG29	YMR134W	714 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	PEX6	YNL329C	3093 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	MCT1	YOR221C	1083 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	UTP14	YML093W	2700 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	VHR2	YER064C	1518 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	ESC2	YDR363W	1371 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	SLY41	YOR307C	1362 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	DBP7	YKR024C	2229 nt		2.72	□□□□□ -1.97
KTR6	P54070	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.71	□□□□□ -1.98
KTR6	P54070	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.71	□□□□□ -1.98
KTR6	P54070	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		2.71	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.5 ms