Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPAP53621 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPAP53621 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPAP53621 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms