Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms