Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNA2P51530 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNA2P51530 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DNA2P51530 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNA2P51530 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNA2P51530 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNA2P51530 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNA2P51530 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms