Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms