Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC2P49815 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC2P49815 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC2P49815 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC2P49815 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC2P49815 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC2P49815 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC2P49815 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC2P49815 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC2P49815 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms