Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU3F4P49335 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms