Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms