Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA4P48058 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA4P48058 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA4P48058 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA4P48058 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA4P48058 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIA4P48058 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms