Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms