Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A1P43005 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms