Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THPOP40225 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THPOP40225 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THPOP40225 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THPOP40225 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THPOP40225 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THPOP40225 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THPOP40225 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THPOP40225 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms