Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		3.81	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YKE2	YLR200W	345 nt		3.81	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	HAA1	YPR008W	2085 nt		3.81	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	SWP82	YFL049W	1872 nt		3.81	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	MDM30	YLR368W	1797 nt		3.81	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	DAL5	YJR152W	1632 nt		3.81	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YHR214C-C	YHR214C-C	1437 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	RPB2	YOR151C	3675 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	ATG26	YLR189C	3597 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	snR68	snR68	136 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YDR262W	YDR262W	819 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YGR017W	YGR017W	894 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	IRC18	YJL037W	675 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	HIT1	YJR055W	495 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	AIM26	YKL037W	357 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	ARG80	YMR042W	534 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YNL089C	YNL089C	477 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YOR331C	YOR331C	558 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	MBA1	YBR185C	837 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YDL199C	YDL199C	2064 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	PSP1	YDR505C	2526 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YML096W	YML096W	1578 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	VID28	YIL017C	2766 nt		3.8	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	SYO1	YDL063C	1863 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	STE24	YJR117W	1362 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	GPI19	YDR437W	423 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	RPL27B	YDR471W	411 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YHI9	YHR029C	885 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	BIG1	YHR101C	1008 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	RPS16A	YMR143W	432 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YPR096C	YPR096C	303 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YSH1	YLR277C	2340 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	CDC55	YGL190C	1581 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	UBP6	YFR010W	1500 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	TDA1	YMR291W	1761 nt		3.79	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	SWC4	YGR002C	1431 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	snR59	snR59	78 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YDR340W	YDR340W	303 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	YDR537C	YDR537C	606 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	COX4	YGL187C	468 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	PET54	YGR222W	882 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	BET3	YKR068C	582 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	TDA8	YAL064C-A	381 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	NNT1	YLR285W	786 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	PDP3	YLR455W	915 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	CMC2	YBL059C-A	330 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	ATG2	YNL242W	4779 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	NCS2	YNL119W	1482 nt		3.78	□□□□□ -1.8
YBR053C	P38235	CDC40	YDR364C	1368 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	HOS3	YPL116W	2094 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	UBP12	YJL197W	3765 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	CDC50	YCR094W	1176 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SPC1	YJR010C-A	285 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	RRI2	YOL117W	1938 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	ULP1	YPL020C	1866 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SLK19	YOR195W	2466 nt		3.77	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SHE4	YOR035C	2370 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	NOP6	YDL213C	678 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	BIO2	YGR286C	1128 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	ECM34	YHL043W	513 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	EMC2	YJR088C	879 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	RIM9	YMR063W	720 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SFM1	YOR021C	642 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	RPC40	YPR110C	1008 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	EPO1	YMR124W	2832 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SRO7	YPR032W	3102 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.76	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	CPR5	YDR304C	678 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	SLX8	YER116C	825 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YKL136W	YKL136W	399 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	RNH203	YLR154C	333 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	YBR051W	YBR051W	351 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	VID24	YBR105C	1089 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	DPB3	YBR278W	606 nt		3.75	□□□□□ -1.81
YBR053C	P38235	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.75	□□□□□ -1.81

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