Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF4P34130 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF4P34130 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF4P34130 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF4P34130 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF4P34130 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF4P34130 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms