Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX2P32243 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTX2P32243 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTX2P32243 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms