Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFNP31947 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFNP31947 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFNP31947 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFNP31947 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFNP31947 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFNP31947 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFNP31947 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms