Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC8P31273 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms