Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLIP1P30622 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms