Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA5P30532 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms