Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms