Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP1P29466 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP1P29466 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP1P29466 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP1P29466 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms