Protein–RNA interactions for Protein: P28817

EHD3, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EHD3P28817 UPF3YGR072W 1164 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 RSR1YGR152C 819 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 RNR2YJL026W 1200 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 YOL134CYOL134C 390 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 ERV15YBR210W 429 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 MMS1YPR164W 4224 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 YNL193WYNL193W 1677 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 URB2YJR041C 3525 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 GIN4YDR507C 3429 nt2.36□□□□□ -2.03
EHD3P28817 AVT2YEL064C 1443 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 STN1YDR082W 1485 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 YLR365WYLR365W 333 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 GAB1YLR459W 1185 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 PML39YML107C 1005 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 ADI1YMR009W 540 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 MPP6YNR024W 561 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 BAG7YOR134W 1230 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 ACM1YPL267W 630 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 YPL276WYPL276W 438 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 AIM4YBR194W 372 nt2.35□□□□□ -2.03
EHD3P28817 AI4Q0065 1671 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 SRO77YBL106C 3033 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 FKS3YMR306W 5358 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 UBC9YDL064W 474 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 RPN8YOR261C 1017 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 ICS2YBR157C 768 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 BNR1YIL159W 4128 nt2.34□□□□□ -2.03
EHD3P28817 PTP3YER075C 2787 nt2.34□□□□□ -2.04
EHD3P28817 MDM36YPR083W 1740 nt2.34□□□□□ -2.04
EHD3P28817 ISW1YBR245C 3390 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 MDM10YAL010C 1482 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 GCV2YMR189W 3105 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 MUB1YMR100W 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 TOP2YNL088W 4287 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 snR70snR70 164 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YPD1YDL235C 504 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 MFA1YDR461W 111 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 HYP2YEL034W 474 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YJR020WYJR020W 333 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 SFT1YKL006C-A 294 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 DLT1YMR126C 1029 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 AIM36YMR157C 768 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 RPL23AYBL087C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 HSP10YOR020C 321 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 GCY1YOR120W 939 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 RRG7YOR305W 729 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YKR078WYKR078W 1758 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 AYT1YLL063C 1425 nt2.33□□□□□ -2.04
EHD3P28817 TFB1YDR311W 1929 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YOL057WYOL057W 2136 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 BUB1YGR188C 3066 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YDR124WYDR124W 975 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YIP5YGL161C 933 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 VMA10YHR039C-A 345 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 DSE2YHR143W 978 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YKL070WYKL070W 510 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 HOT13YKL084W 351 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 FMP41YNL168C 780 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 IRC13YOR235W 315 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 RRG8YPR116W 834 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YKU80YMR106C 1890 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 ARK1YNL020C 1917 nt2.32□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YJL132WYJL132W 2253 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 PDR3YBL005W 2931 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 TRA1YHR099W 11235 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 RLI1YDR091C 1827 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 FIR1YER032W 2631 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 KEL2YGR238C 2649 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 PSD2YGR170W 3417 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 TRM2YKR056W 1920 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 RPL6BYLR448W 531 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 PRM6YML047C 1059 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YBL055CYBL055C 1257 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 UTP6YDR449C 1323 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 SMY2YBR172C 2223 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YBT1YLL048C 4986 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 JJJ2YJL162C 1752 nt2.31□□□□□ -2.04
EHD3P28817 PDR1YGL013C 3207 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 HAA1YPR008W 2085 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YPP1YGR198W 2454 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 DPP1YDR284C 870 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 PPE1YHR075C 1203 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 CCL1YPR025C 1182 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 snR35snR35 204 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 SGM1YJR134C 2124 nt2.3□□□□□ -2.04
EHD3P28817 SLN1YIL147C 3663 nt2.29□□□□□ -2.04
EHD3P28817 SEN54YPL083C 1404 nt2.29□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.29□□□□□ -2.04
EHD3P28817 YGL177WYGL177W 348 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.3 ms