Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms