Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPREP23469 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPREP23469 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPREP23469 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPREP23469 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPREP23469 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPREP23469 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPREP23469 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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