Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms