Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms