Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NF1P21359 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NF1P21359 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NF1P21359 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NF1P21359 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NF1P21359 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NF1P21359 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms