Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms