Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TFE3P19532 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFE3P19532 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFE3P19532 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFE3P19532 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFE3P19532 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFE3P19532 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFE3P19532 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TFE3P19532 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFE3P19532 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFE3P19532 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFE3P19532 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFE3P19532 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFE3P19532 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFE3P19532 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFE3P19532 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFE3P19532 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms