Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms