Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms