Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms