Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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