Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC130P13994 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms