Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEACAM1P13688 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM1P13688 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms