Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms