Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2P10911 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2P10911 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCF2P10911 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCF2P10911 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2P10911 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2P10911 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms