Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms