Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GLI3P10071 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GLI3P10071 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GLI3P10071 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI3P10071 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI3P10071 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI3P10071 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLI3P10071 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI3P10071 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI3P10071 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI3P10071 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI3P10071 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI3P10071 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms