Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CGB3P0DN86 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGB3P0DN86 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms