Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD2P0DJD1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms