Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00032P0C843 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms