Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB5P09067 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB5P09067 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms