Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3DP05423 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms