Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYCNP04198 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYCNP04198 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYCNP04198 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYCNP04198 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYCNP04198 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYCNP04198 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYCNP04198 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYCNP04198 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms