Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP1P01033 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms