Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHAP00338 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHAP00338 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHAP00338 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHAP00338 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHAP00338 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHAP00338 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms