Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTN1O94822 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTN1O94822 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTN1O94822 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTN1O94822 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTN1O94822 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTN1O94822 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LTN1O94822 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms