Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNKO75909 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNKO75909 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms